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基于氨基酸组成和二级结构的beta桶跨膜蛋白的识别

2003年 基础理论
  • 成果简介
与alpha跨膜蛋白不同,beta桶跨膜蛋白很难与其它的蛋白,特别是beta结构的水溶性蛋白区分开来。该文分析了12个beta桶跨膜蛋白的跨膜区和79个beta结构的水溶性蛋白的beta区的氨基酸组成。分别计算了各氨基酸在这两类中组成的平均值和方差。
基于Fisher提出的鉴别率,Gly, Asn和Val等与分类最相关的氨基酸被挑选出来。由此而建立的线性分类器用来识别1...
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