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蛋白质的口袋、袋口与药物成分的尺寸的精确计算计划

2014年 基础理论
  • 成果简介
  (1)建立了一套基于Autodock、Ligand Explorer以及分子动态模拟为工具的可计算指标体系。用于针对已知蛋白质结构下筛选或设计药物分子、评估药物分子有效性以及抗耐药性。该指标体系包含了5个指标,它们分别是:最小自由能(MFE),可以由Autodock给出;非共价键的数量和非共价键的分布均匀度,可由Ligand Explorer给出;药物分子与pocket结合的紧致度,其依赖于p...
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